La dirección y administración del Instituto de Derechos Humanos Santo Domingo está a cargo de dos instancias básicas:
La Asamblea General , constituida por todos los Miembros del Instituto, y presidida por el Presidente de la Junta Directiva.
La Junta Directiva, compuesta por cinco miembros: un presidente, un Vicepresidente, un Secretario, un Tesorero y un Vocal.
Tipos de Miembros
El IDHSD está compuesto por dos tipos de miembros:
Miembros Activos , personas físicas y morales que identificadas con la misión del IDHSD, han presentado su solicitud de afiliación y ésta ha sido aprobada por la Junta Directiva.
Miembros Honorarios o Asesores , personas físicas nombradas mediante resolución de la Junta Directiva, por sus notables contribuciones a las actividades del IDHSD.